Industri pengolahan hasil laut merupakan salah satu klaster unggulan strategis yang didorong oleh pemerintah untuk berkembang pesat. Saat ini perusahaan agroindustri banyak bermunculan, mulai dari skala kecil sampai besar. Perusahaan X, obyek penelitian ini, merupakan representatif industri skala menengah yang sudah mengekspor produknya ke beberapa negara di Asia. Di sisi lain, perusahaan menghadapi kendala, seperti sensitivitas terhadap perubahan suhu, penyimpangan kualitas dan keamanan pangan. Tujuan penelitian ini adalah memberikan rancangan mitigasi dengan pendekatan manajemen risiko kualitas. Seluruh aktivitas dipetakan menggunakan supply chain operations reference (SCOR) model, lalu diidentifikasi risikonya menggunakan metode Delphi. Hasil analisa menunjukkan terdapat 41 potensi risiko, yang kemudian dianalisa menggunakan house of risk (HOR) 1 dan diperoleh 5 risiko kritis. Kemudian disusun sejumlah alternatif mitigasi, dan dinilai menggunakan HOR 2. Dari hasil analisa, diperoleh 9 strategi mitigasi yang dapat diterapkan pada perusahaan dengan skala yang sama.